首先，各统筹地区要确定一个适合当地职工负担水平的个人基本医疗保险缴费率，一般为工资收入的2％，有条件的地区也可以适当提高个人缴费的比例。
其次，由个人以本人工资收入为基数，按规定的当地的个人缴费率缴纳基本医疗保险费。在个人缴费基数，应该指出不是按本人基本工资或标准工资为基数，而是按国家统计局规定的工资收入统计口径为基数，即以全部工资性收入，包括各类奖金、劳务收入和实物收入等所有工资性收入为基数，乘以规定的个人缴费率，即为本人应缴纳的基本医疗保险费。
第三，个人缴费一般不需个人到社会保险经办机构去缴纳，而是由单位从工资收入中代扣代缴。
